您所在的位置:首页 > 科技 > 北京基因组所开发基因组变异-表型关联知识库

北京基因组所开发基因组变异-表型关联知识库

日期:2019-10-31 11:33:00

近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的世界第一个gwas地图集正式发布。研究结果在线发表在国际学术期刊《核酸研究》上,标题为《GWAS地图集:植物和动物全基因组变异训练协会精选资源》。

全基因组关联研究(gwas)是指找出整个基因组中的序列变异,筛选出与疾病、表型性状等相关的基因座。挖掘复杂生物性状的遗传基础是一项关键技术。随着高通量测序技术的快速发展,许多物种产生了越来越多的高质量基因型数据,并分析了与许多复杂动植物性状相关的基因座。然而,这些知识信息分散在不同的文档中,不利于知识的集成、挖掘和重用。为此,国家基因组科学数据中心的科研人员构建了主要农作物和畜牧业动物的基因型-表型关联知识,并通过关键词搜索、人工编辑、条目比较和注释等技术手段,开发了世界上第一个基因型变异-表型关联知识库gwas图谱。

Gwas图谱知识库整合了与9个物种(包括棉花、梅花、玉米、油菜籽、水稻、高粱、大豆7种植物和山羊、猪2种动物)614个性状相关的75467个基因型-表型(g2p)信息,并将其映射到5个不同的性状本体(植物性状本体pto、牲畜性状本体atol、作物本体co等)。)通过语义比较,方便用户通过基于本体的层次结构找到感兴趣的特征和相应的g2p相关信息。此外,研究人员还分析并定义了与多种性状相关的多个基因和基因座,以支持用户通过不同模块在线浏览、检索和下载。

Gwas图谱作为第一个全面的多物种变异性状关联知识库,是全基因组变异信息库(gvm)的延伸,将为未来重要农艺性状的模块化遗传研究和育种应用提供重要的资源和平台。该研究由中国科学院战略试点科技项目和中国科学院国际重大科学项目资助。

Gwas地图集资源信息统计


hg0088备用网址

图片新闻

Costco遭会员疯狂退卡,这次可不怪"国民素质低"

Costco遭会员疯狂退卡,这次可不怪"国民素质低"

  • costco开业那几天,媒体纷纷刷屏式报道上海人的疯狂,平时最精明的上海大爷大妈,竟然把这家大店挤爆到暂停营业了。因为这家costco的经营风格,是「质优价廉」。costco这家公司最变态的一点就是,
多家跑腿平台在郑“同城竞速”郑州市民如何下单才能最便宜?

多家跑腿平台在郑“同城竞速”郑州市民如何下单才能最便宜?

  • 多家配送平台在郑州同城再搭较量场,是否会给消费者使用帮买帮送业务带来福利?起步价2公里内收取10元,顺丰帮买定价标准高度类似uu跑腿继uu跑腿、达达等同城配送平台之后,顺丰也在郑州试水跑腿帮买业务。那
科幻电影成真!LG展示透明OLED技术

科幻电影成真!LG展示透明OLED技术

  • 近日lg公司与英国知名百货公司哈德罗百货进行合作,在他们的橱窗中展示了他们全新的透明oled电视。这款透明oled电视尺寸为55英寸,充满了科技感。lg展示透明oled技术据了解,相比lcd,oled
2019全球互联网通信云大会

2019全球互联网通信云大会

  • 事件:11月30日上海,融云联合极客邦科技举办2019全球互联网通信云大会,这是全球范围内首个围绕互联网通信云技术开展研讨的行业技术会议。深南电路:公司积极开发下一代5g无线通信基站用pcb产品,为下
三部门:划转部分国有资本充实社保基金要在2020年底前基本完

三部门:划转部分国有资本充实社保基金要在2020年底前基本完

  • 用户成功预约后,可享受自订购中国联通全国统一5g套餐次月起连续6个月内5g套餐折扣优惠。截至发稿前,中国联通、中国电信的预约用户数分别超过69万和70万。三大运营商的5g预约总人数已经超过500万。对
Galaxy Fold曝出新缺陷:转轴上的品牌Logo竟然掉

Galaxy Fold曝出新缺陷:转轴上的品牌Logo竟然掉

  • 对于三星的首款折叠屏智能机 galaxy fold 来说,其从发布之初到上市后的路途,可谓是艰难波折。可惜对于这家韩国科技巨头来说,galaxy fold 的品质表现,并未让人感到诚意。早前 ifix
Vivo:移动终端5G影响力第一 Nex 3解决5G三大难题

Vivo:移动终端5G影响力第一 Nex 3解决5G三大难题

  • 2019年,vivo在3gpp的提案数量超过2700篇,影响力全球top 10,在国内专注于移动终端研发的厂商中排名第一,5g专利申请超过2000项。针对5g带来的挑战,vivo在nex 3 5g手机
在App Store里,苹果会偏袒自家的应用吗?

在App Store里,苹果会偏袒自家的应用吗?

  • 随着app store的不断壮大,苹果收到的垄断质疑也越来越多。对于垄断的说法,苹果公司予以否认。在app store的搜索结果中,排名前几位的是网络经济中竞争最激烈的不动产。app store去年的
刚刚,你@微信官方 了吗

刚刚,你@微信官方 了吗

  • 今早,你的朋友圈有没有被这条内容刷屏?大家都在@ 微信官方。就算你发n条“给我一面国旗@微信官方”,微信官方都不会理你。评论也是被刷屏还有淘气的朋友——不过,腾讯新闻官方的确是有“领取你的国庆专属头像
“语音交互”技术帮助盲人点外卖

“语音交互”技术帮助盲人点外卖

  • 中国青年报客户端北京10月15日电 今天是第35个“国际盲人节”,“美团语音盲人定制应用”同时上线。该应用由中国盲人协会与美团合作发布,盲人可通过美团app用“语音交互”的方式完成外卖下单全流程,这也